•  「10x Visium HD 空间转录组测序」 

    10x Visium HD 空间转录组测序技术推动了空间转录组技术的新时代,以单细胞级分辨率提升了已验证的全转录组空间信息分析能力,实现了全组织覆盖。通过创新的探针设计和 Visium CytAssist 技术的支持,Visium HD 工作流程能够提供一流的数据质量,为空间生物学研究带来前所未有的深度和广度。

    10x Visium HD 空间转录组平台用于解析组织切片中 mRNA 的空间表达信息,采用探针捕获的方式覆盖人约 18000 个基因和小鼠约19000 个基因。HD 载玻片上有两个芯片区域。每个芯片捕获区域为 6.5mm x 6.5mm,区域内布满携带空间信息标签的寡核苷酸。每个捕获区域由 1100 万个 2 x 2 µm、紧密相连 “无间隙” 的小方格构成,以此实现全组织覆盖。在 VisiumCytAssist 仪器中,组织玻片与 HD 芯片通过延伸反应,捕获杂交探针,进而精准获取组织切片上 mRNA 的空间表达信息 。

    实验流程

    技术原理

  • 1. 单细胞分辨率:Visium HD 系统将分辨率从 55 µm spots 提升至 2x2 µm 正方形,实现单细胞水平的空间组织结构分析;

    2. 全组织覆盖:Visium HD 凭借全组织覆盖和高分辨率,能够探索微小组织结构的独特生物学特征,精准定位组织驻留细胞群(如免疫细胞或癌细胞),揭示细胞间相互作用及其对疾病或治疗反应的影响;

    3. 高数据质量:基于 CytAssist 的一体化工作流程,简化样本前处理,同时通过三对探针捕获,显著提高基因检出率;

    4. 高样本兼容性:支持载玻片切片样本,并将 DV200 质控要求降低至 >30%,可检测更多长期保存或高度降解的样本。

     「技术优势」 

  •  「结果展示」 

    空间转录组细胞分群结果

    空间位置展示关注基因表达分布的featureplot图

    A 品 c

    通过靶基因结合基序的活性着色的UMAP投影

    空间位置展示亚群细胞分布情况

  •  「送样指南」