•  「10x Visium CytAssist V2空间转录组测序」 

    10xVisium CytAssist 是一款精巧的台式仪器,专为空间转录组分析打造。它能将转录组探针从标准显微镜载玻片自动转移至 Visium 玻片,支持新鲜冰冻(FF)、甲醛固定(FxF)、石蜡包埋(FFPE)等多种样本类型的空间组学研究。该仪器与苏木精 - 伊红(H&E)染色、免疫荧光(IF)染色相兼容,让预先保存的 FFPE 组织切片可便捷融入 Visium 工作流程,无需在 Visium 玻片上直接贴片。 CytAssist 实现了空间转录组实验的自动化、标准化与高效化,克服了手动操作不稳定、样本因保存久致质量下滑等难题。凭借创新设计,病理科存档的 FFPE 样本也能开展空间转录组分析,为科研人员提供更灵活的样本选择,助力深度挖掘多样样本的空间组学奥秘。

    技术原理

    在 Visium CytAssist 工作流程中,针对 FFPE 组织切片,先在普通玻片上依次完成脱蜡、染色、成像、解交联以及探针杂交操作。其中,探针杂交运用 RNA 模板连接机制,通过设计成对探针与靶标结合并连接。之后,将两张已处理的普通玻片和一张带有两个捕获区域(尺寸为 6.5mm×6.5mm 或 11mm×11mm)的 Visium 建库芯片,一同放入 CytAssist 仪器内,使组织切片与捕获区域精准对齐。组织渗透后,释放已连接的探针对,使其与捕获载玻片上的探针结合,从而捕获基因表达信息。 此外,基于相同的探针杂交原理,OCT 冰冻样本也可借助 CytAssist 开展分析,这使得 FFPE 和冰冻样本能在同一平台实现空间转录组研究 。

    • 捕获框  ( 6.5x6.5mm)

    • 大约5000个 spots

    • 测序量80G

    •捕获框  ( 11x11mm)

    •大约14000个 spots

    •测序量150G 需要提前预约

    实验流程

  • 1. 自动化流程:转录组 / 蛋白组分 物自动转移至 Visium 玻片,简化样本处理;

    2. 样本兼容性强:支持 FF、FxF、FFPE 样本,兼容病理包埋块切片,无需新鲜切片,样本选择更灵活;

    3. 高效操作:CytAssist 专用玻片单次运行≤1 小时,支持 2 张 FFPE 切片同步捕获;

    4. 超大捕获面积:提供 6.5×6.5mm² 和 11×11mm² 芯片,覆盖更大组织区域;

    5. 低 RNA 质控门槛:RNA 质检标准降至 DV200>30%,兼容更多存档样本。

     「技术优势」 

  •  「结果展示」 

    空间转录组细胞分群结果

    空间转录组不同细胞类型占比饼状图

    A 品 c

    通过靶基因结合基序的活性着色的UMAP投影

    空间转录组不同细胞类型基因表达气泡图

    不同样本细胞类型空间分布结果

    空间转录组细胞注释结果

  •  「送样指南」