•  「10x 单细胞Flex转录组测序」 

    10x Flex 采用 4% 多聚甲醛(PFA)固定样本,能精准定格细胞的瞬时基因表达状态。作为免疫组织化学和细胞培养固定领域常用的固定剂,4% PFA 在保护组织和细胞形态结构的同时,可确保核酸完整。实验时,先把新鲜组织解离成高活性单细胞悬液,再用 PFA 固定,如此一来,样本能在一定时间内稳定存储与运输,不必担忧细胞活性迅速降低,大大提升了实验操作的灵活性。

    技术原理及实验流程

    单细胞基因表达 Flex 基于探针杂交原理。该技术针对已知序列设计探针,让成对探针与 RNA 进行原位杂交,随后对探针扩增,再用 Gel Beads 捕获探针,进而构建文库并测序。 目前,Flex 方案仅适用于人和小鼠样本。其配套的杂交探针带有可区分样本来源的 Probe Barcode,每个样本与特定探针杂交后会带上独特的 Barcode 标记。在数据分析阶段,通过识别这些 Barcode,就能区分不同样本来源的 reads。基于此,Flex 提供两种实验方案:单样本实验和混合样本实验,具体内容如下:

     10x 单细胞Flex转录组测序单样本实验流程

    10x 单细胞Flex转录组测序混合多样本实验流程

  • 1. 扩展样本范围:支持FFPE细胞、组织及PFA固定样本的单细胞测序,突破新鲜组织限制,解锁医院和生物样本库中大量FFPE样本的宝贵信息;

    2. 简化流程:FFPE样本易获取、易运输且成本低,使样本采集更灵活,实验安排更便捷;

    3. 提升灵敏度:与单细胞3’RNA相比,Flex在相同测序数据量下饱和度更高,探针灵敏度更强,单个细胞内检测到的基因数更多;

    4. 兼容10x Visium FFPE空间转录组:Flex与10x Visium FFPE技术无缝结合,可对同一FFPE样本进行单细胞和空间转录组分析,数据一致性和匹配性更优。

     「技术优势」 

  •  「结果展示」 

    多样本联合细胞注释结果

    marker基因气泡图展示

    RO/E细胞占比分析

    基因集分析

  •  「送样指南」