数据上传避坑指南（下篇）：GSA 数据库上传保姆级教程

 

在上篇中，我们已经解决了“选哪个库”和“GEO怎么传”的问题。如果你的数据涉及中国人类遗传资源、临床队列或国内项目结题要求，那GSA才是正确选择。本篇就来手把手带你走通GSA上传全流程，建议先收藏，再对照操作。

GSA 用户可通过大数据中心生物数据统一汇交入口——生物数据递交系统（BIG Submission，BIG Sub）完成一站式数据递交。若涉及人类遗传资源，根据《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》，必须提交到GSA-Human，实现受控访问。

一、用户注册

   进入生物数据递交系统（BIG Submission，BIG Sub，https://bigd.big.ac.cn/gsub/）完成账号注册，建议使用实验室公共邮箱进行注册。如果用于文章发表或数据共享，建议用英文填写注册信息，以方便日后国际化展示。

二、创建GSA数据集

     为保证元数据信息与测序数据文件的一致性与完整性，便于后续数据使用者检索与使用，通过 BIG Sub 统一入口递交 GSA 数据信息时，用户需要为GSA 数据集的研究任务创建BioProject，并为数据集的实验样本创建相应的 BioSample(s)。

1、创建BioProject

（1）按要求填写提交者信息，需填写英文信息

（2）填写基本信息：这样部分包括发布日期、项目概括、项目资金信息、项目相关网站等

（3）填写项目类型：按实际情况填写即可

（4）填写出版信息：没有可不填

（5）确认信息无误后提交

2、创建Biosample

     BioSample 用于描述每个实验样本。

（1）填写提交者信息及基本信息，与上一步填写要求一致

（2）选择样本类型——用于批量提交样本的属性信息，这里以模式动物为例

（3）填写样本属性

     下载模板文件，如上图中的 Model_animal.cn.xlsx (中文版)，e.g. Model_animal.cn.xlsx 为例子文档。编辑模板文件并检查无误后，通过文件选择框进行文件上传。

（4）核对信息，确认无误后提交

3、新建GSA

（1）填写提交者信息及基本信息

（2）元数据信息填写：包括测序平台、测序策略、样本来源、富集方法、数据格式等

（3）文件上传

（4）确认无误后提交